Наукову діяльність Музею спрямовано на розробку проєктів, які мають на меті чітке висвітлення воєнно-політичних аспектів столітньої боротьби українців за свою свободу.
У фокусі досліджень науковців Музею перебувають, зокрема, людські військові втрати, форми спротиву тоталітарним і авторитарним режимам, фіксування та інтерпретація геноцидних практик стосовно народів України.
Окрему увагу надається соціогуманітарним складникам та явищам у війні – ментальним, гендерним, демографічним наслідкам депортацій, голоду, примусових робіт, переслідувань за національною та іншими ознаками.
Нинішню боротьбу України проти російської агресії науковці розглядають як продовження історії визвольних змагань і державотворчих процесів ХХ ст., на які справили визначальний вплив світові війни минулого.
